Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms