Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRSF5Q13243 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms