Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP107P57740 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms