RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.5■■■■■ 4.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.03■■■■□ 3.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCC9O60706 1549 aa36.64■■■■□ 3.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.1■■■■□ 3.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NACADO15069 1562 aa34.98■■■■□ 3.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.89■■■■□ 3.18
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.68■■■■□ 3.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.35■■■■□ 3.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.23■■■■□ 3.07
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.21■■■■□ 3.07
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.1■■■■□ 3.05
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.02■■■■□ 3.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCRIBQ14160 1630 aa33.71■■■□□ 2.99
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.69■■■□□ 2.98
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.13■■■□□ 2.89
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.01■■■□□ 2.88
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NCAPD3P42695 1498 aa32.32■■■□□ 2.76
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMARCA4P51532 1647 aa32.25■■■□□ 2.75
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMARCA2P51531 1590 aa32.16■■■□□ 2.74
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HMGXB3Q12766 1538 aa32.05■■■□□ 2.72
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.98■■■□□ 2.71
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.95■■■□□ 2.71
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERCC6Q03468 1493 aa31.64■■■□□ 2.66
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NESP48681 1621 aa31.59■■■□□ 2.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WIZO95785 1651 aa31.55■■■□□ 2.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CUX2O14529 1486 aa31.49■■■□□ 2.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.48■■■□□ 2.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.35■■■□□ 2.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.33■■■□□ 2.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.15■■■□□ 2.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.09■■■□□ 2.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CFTRP13569 1480 aa31.06■■■□□ 2.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.98■■■□□ 2.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.95■■■□□ 2.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.93■■■□□ 2.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.89■■■□□ 2.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WDR62O43379 1518 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRDM2Q13029 1718 aa30.67■■■□□ 2.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCC8Q09428 1581 aa30.44■■■□□ 2.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TOPBP1Q92547 1522 aa30.39■■■□□ 2.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFT140Q96RY7 1462 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OSCARQ8IYS5 282 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SOGA1O94964 1423 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CUX1P39880 1505 aa29.99■■■□□ 2.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.98■■■□□ 2.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WDR97A6NE52 1622 aa29.85■■■□□ 2.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM41Q8WV44 630 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FBLN2P98095 1184 aa29.74■■■□□ 2.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GRIN2BQ13224 1484 aa29.7■■■□□ 2.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHD1O14646 1710 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.68■■■□□ 2.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TOP2BQ02880 1626 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGEF11O15085 1522 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYNJ1O43426 1573 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYNJ2O15056 1496 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.54■■■□□ 2.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PBRM1Q86U86 1689 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARAP1Q96P48 1450 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GRIN2AQ12879 1464 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADAMTS12P58397 1594 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUP160Q12769 1436 aa29.2■■■□□ 2.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEP170Q5SW79 1584 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF27Q86VH2 1401 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGF1RP08069 1367 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SHROOM2Q13796 1616 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 JPH4Q96JJ6 628 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CUL7Q14999 1698 aa28.93■■■□□ 2.22
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