Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZBED1O96006 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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