Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAF2Q96CS3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms