Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NR1D2Q14995 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NR1D2Q14995 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NR1D2Q14995 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NR1D2Q14995 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NR1D2Q14995 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NR1D2Q14995 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NR1D2Q14995 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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