Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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UBE2V1Q13404 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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UBE2V1Q13404 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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UBE2V1Q13404 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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UBE2V1Q13404 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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UBE2V1Q13404 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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UBE2V1Q13404 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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UBE2V1Q13404 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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UBE2V1Q13404 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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UBE2V1Q13404 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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UBE2V1Q13404 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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UBE2V1Q13404 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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