Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2V1Q13404 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2V1Q13404 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2V1Q13404 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2V1Q13404 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE2V1Q13404 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2V1Q13404 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2V1Q13404 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2V1Q13404 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2V1Q13404 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2V1Q13404 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2V1Q13404 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2V1Q13404 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2V1Q13404 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2V1Q13404 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2V1Q13404 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2V1Q13404 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2V1Q13404 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2V1Q13404 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2V1Q13404 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2V1Q13404 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2V1Q13404 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2V1Q13404 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2V1Q13404 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2V1Q13404 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2V1Q13404 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2V1Q13404 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE2V1Q13404 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2V1Q13404 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2V1Q13404 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBE2V1Q13404 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2V1Q13404 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2V1Q13404 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2V1Q13404 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2V1Q13404 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2V1Q13404 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2V1Q13404 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2V1Q13404 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2V1Q13404 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2V1Q13404 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2V1Q13404 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2V1Q13404 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2V1Q13404 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2V1Q13404 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2V1Q13404 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2V1Q13404 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2V1Q13404 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2V1Q13404 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2V1Q13404 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2V1Q13404 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2V1Q13404 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2V1Q13404 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2V1Q13404 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2V1Q13404 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2V1Q13404 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2V1Q13404 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2V1Q13404 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2V1Q13404 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2V1Q13404 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2V1Q13404 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBE2V1Q13404 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE2V1Q13404 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2V1Q13404 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2V1Q13404 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2V1Q13404 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2V1Q13404 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2V1Q13404 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2V1Q13404 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2V1Q13404 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2V1Q13404 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2V1Q13404 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2V1Q13404 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2V1Q13404 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2V1Q13404 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2V1Q13404 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2V1Q13404 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2V1Q13404 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2V1Q13404 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE2V1Q13404 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE2V1Q13404 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE2V1Q13404 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE2V1Q13404 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE2V1Q13404 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE2V1Q13404 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBE2V1Q13404 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE2V1Q13404 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
UBE2V1Q13404 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
UBE2V1Q13404 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UBE2V1Q13404 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UBE2V1Q13404 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
UBE2V1Q13404 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2V1Q13404 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2V1Q13404 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2V1Q13404 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2V1Q13404 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2V1Q13404 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2V1Q13404 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2V1Q13404 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2V1Q13404 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2V1Q13404 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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