Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYP27A1Q02318 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms