Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBX1P83916 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBX1P83916 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBX1P83916 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBX1P83916 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
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