RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585313.5

IFT20-215, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

APPRIS P4 TSL 3 BASIC

Gene IFT20, Length 852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-215ENST00000585313 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.07■■■■□ 3.69
IFT20-215ENST00000585313 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.45■■■□□ 2.95
IFT20-215ENST00000585313 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
IFT20-215ENST00000585313 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.61■■■□□ 2.65
IFT20-215ENST00000585313 ABCC9O60706 1549 aa31.41■■■□□ 2.62
IFT20-215ENST00000585313 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.3■■■□□ 2.6
IFT20-215ENST00000585313 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.14■■■□□ 2.58
IFT20-215ENST00000585313 NACADO15069 1562 aa31.09■■■□□ 2.57
IFT20-215ENST00000585313 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.83■■■□□ 2.53
IFT20-215ENST00000585313 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.71■■■□□ 2.51
IFT20-215ENST00000585313 SCRIBQ14160 1630 aa30.53■■■□□ 2.48
IFT20-215ENST00000585313 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.26■■■□□ 2.43
IFT20-215ENST00000585313 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.86■■■□□ 2.37
IFT20-215ENST00000585313 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.48■■■□□ 2.31
IFT20-215ENST00000585313 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
IFT20-215ENST00000585313 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.47■■■□□ 2.31
IFT20-215ENST00000585313 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
IFT20-215ENST00000585313 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
IFT20-215ENST00000585313 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.35■■■□□ 2.29
IFT20-215ENST00000585313 SMARCA4P51532 1647 aa29.34■■■□□ 2.29
IFT20-215ENST00000585313 WIZO95785 1651 aa29.14■■■□□ 2.26
IFT20-215ENST00000585313 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.05■■■□□ 2.24
IFT20-215ENST00000585313 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
IFT20-215ENST00000585313 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
IFT20-215ENST00000585313 SMARCA2P51531 1590 aa28.89■■■□□ 2.22
IFT20-215ENST00000585313 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.81■■■□□ 2.2
IFT20-215ENST00000585313 HMGXB3Q12766 1538 aa28.66■■■□□ 2.18
IFT20-215ENST00000585313 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
IFT20-215ENST00000585313 NCAPD3P42695 1498 aa28.61■■■□□ 2.17
IFT20-215ENST00000585313 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.54■■■□□ 2.16
IFT20-215ENST00000585313 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.5■■■□□ 2.15
IFT20-215ENST00000585313 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.24■■■□□ 2.11
IFT20-215ENST00000585313 PRDM2Q13029 1718 aa28.03■■■□□ 2.08
IFT20-215ENST00000585313 CFTRP13569 1480 aa27.94■■■□□ 2.06
IFT20-215ENST00000585313 ABCC8Q09428 1581 aa27.84■■■□□ 2.05
IFT20-215ENST00000585313 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.82■■■□□ 2.04
IFT20-215ENST00000585313 TRIM41Q8WV44 630 aa27.8■■■□□ 2.04
IFT20-215ENST00000585313 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.73■■■□□ 2.03
IFT20-215ENST00000585313 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.72■■■□□ 2.03
IFT20-215ENST00000585313 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.65■■■□□ 2.02
IFT20-215ENST00000585313 SYNJ1O43426 1573 aa27.64■■■□□ 2.01
IFT20-215ENST00000585313 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.63■■■□□ 2.01
IFT20-215ENST00000585313 TOP2BQ02880 1626 aa27.6■■■□□ 2.01
IFT20-215ENST00000585313 NESP48681 1621 aa27.55■■■□□ 2
IFT20-215ENST00000585313 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.53■■■□□ 2
IFT20-215ENST00000585313 CUX1P39880 1505 aa27.49■■□□□ 1.99
IFT20-215ENST00000585313 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.43■■□□□ 1.98
IFT20-215ENST00000585313 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.4■■□□□ 1.98
IFT20-215ENST00000585313 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.37■■□□□ 1.97
IFT20-215ENST00000585313 EEA1Q15075 1411 aa27.37■■□□□ 1.97
IFT20-215ENST00000585313 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.35■■□□□ 1.97
IFT20-215ENST00000585313 SOGA1O94964 1423 aa27.24■■□□□ 1.95
IFT20-215ENST00000585313 TOPBP1Q92547 1522 aa27.24■■□□□ 1.95
IFT20-215ENST00000585313 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
IFT20-215ENST00000585313 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.19■■□□□ 1.94
IFT20-215ENST00000585313 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
IFT20-215ENST00000585313 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.13■■□□□ 1.93
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IFT20-215ENST00000585313 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
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IFT20-215ENST00000585313 KIF21BO75037 1637 aa27.05■■□□□ 1.92
IFT20-215ENST00000585313 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.03■■□□□ 1.92
IFT20-215ENST00000585313 WDR97A6NE52 1622 aa27.03■■□□□ 1.92
IFT20-215ENST00000585313 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.03■■□□□ 1.92
IFT20-215ENST00000585313 WDR62O43379 1518 aa27.01■■□□□ 1.91
IFT20-215ENST00000585313 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27■■□□□ 1.91
IFT20-215ENST00000585313 ERCC6Q03468 1493 aa27■■□□□ 1.91
IFT20-215ENST00000585313 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
IFT20-215ENST00000585313 CUX2O14529 1486 aa26.96■■□□□ 1.91
IFT20-215ENST00000585313 GOLGA3Q08378 1498 aa26.93■■□□□ 1.9
IFT20-215ENST00000585313 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.91■■□□□ 1.9
IFT20-215ENST00000585313 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
IFT20-215ENST00000585313 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.88■■□□□ 1.89
IFT20-215ENST00000585313 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.84■■□□□ 1.89
IFT20-215ENST00000585313 PRXQ9BXM0 1461 aa26.84■■□□□ 1.89
IFT20-215ENST00000585313 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.78■■□□□ 1.88
IFT20-215ENST00000585313 IFT140Q96RY7 1462 aa26.77■■□□□ 1.88
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IFT20-215ENST00000585313 IGF1RP08069 1367 aa26.74■■□□□ 1.87
IFT20-215ENST00000585313 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.74■■□□□ 1.87
IFT20-215ENST00000585313 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.69■■□□□ 1.86
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IFT20-215ENST00000585313 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
IFT20-215ENST00000585313 CEP162Q5TB80 1403 aa26.61■■□□□ 1.85
IFT20-215ENST00000585313 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
IFT20-215ENST00000585313 GRIN2BQ13224 1484 aa26.53■■□□□ 1.84
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IFT20-215ENST00000585313 ADAMTS12P58397 1594 aa26.5■■□□□ 1.83
IFT20-215ENST00000585313 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
IFT20-215ENST00000585313 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.47■■□□□ 1.83
IFT20-215ENST00000585313 CLIP1P30622 1438 aa26.43■■□□□ 1.82
IFT20-215ENST00000585313 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.42■■□□□ 1.82
IFT20-215ENST00000585313 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
IFT20-215ENST00000585313 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.33■■□□□ 1.81
IFT20-215ENST00000585313 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.23■■□□□ 1.79
IFT20-215ENST00000585313 SYNJ2O15056 1496 aa26.22■■□□□ 1.79
IFT20-215ENST00000585313 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.22■■□□□ 1.79
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