Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RSPO3Q9BXY4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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