Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD1Q6UXZ0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms