Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ACTBP60709 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ACTBP60709 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ACTBP60709 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ACTBP60709 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ACTBP60709 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ACTBP60709 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ACTBP60709 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ACTBP60709 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ACTBP60709 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ACTBP60709 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ACTBP60709 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ACTBP60709 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ACTBP60709 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ACTBP60709 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ACTBP60709 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ACTBP60709 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ACTBP60709 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ACTBP60709 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ACTBP60709 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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