Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSHP23434 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms