Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA1CQ9BQE3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms