Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PMCHL1Q16048 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms