Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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PKP1Q13835 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PKP1Q13835 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PKP1Q13835 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PKP1Q13835 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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PKP1Q13835 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PKP1Q13835 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PKP1Q13835 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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