Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX9Q9Y5X1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX9Q9Y5X1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX9Q9Y5X1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX9Q9Y5X1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX9Q9Y5X1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX9Q9Y5X1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX9Q9Y5X1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX9Q9Y5X1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX9Q9Y5X1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX9Q9Y5X1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX9Q9Y5X1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX9Q9Y5X1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX9Q9Y5X1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms