Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPA4Q9UI42 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CPA4Q9UI42 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPA4Q9UI42 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CPA4Q9UI42 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms