Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF10DQ9UBN6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF10DQ9UBN6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF10DQ9UBN6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF10DQ9UBN6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF10DQ9UBN6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFRSF10DQ9UBN6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF10DQ9UBN6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF10DQ9UBN6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF10DQ9UBN6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF10DQ9UBN6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF10DQ9UBN6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFRSF10DQ9UBN6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF10DQ9UBN6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF10DQ9UBN6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF10DQ9UBN6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF10DQ9UBN6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFRSF10DQ9UBN6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF10DQ9UBN6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF10DQ9UBN6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms