Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ASCL3Q9NQ33 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASCL3Q9NQ33 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms