Protein–RNA interactions for Protein: Q9H714

RUBCNL, Protein RUBCNL-like, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNLQ9H714 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUBCNLQ9H714 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUBCNLQ9H714 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUBCNLQ9H714 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms