Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA4CQ9C0C4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4CQ9C0C4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms