Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPN18Q99952 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPN18Q99952 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPN18Q99952 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPN18Q99952 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPN18Q99952 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPN18Q99952 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN18Q99952 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN18Q99952 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN18Q99952 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN18Q99952 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN18Q99952 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN18Q99952 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN18Q99952 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN18Q99952 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN18Q99952 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN18Q99952 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN18Q99952 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN18Q99952 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN18Q99952 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN18Q99952 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN18Q99952 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN18Q99952 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PTPN18Q99952 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN18Q99952 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN18Q99952 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN18Q99952 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN18Q99952 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN18Q99952 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN18Q99952 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN18Q99952 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN18Q99952 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PTPN18Q99952 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN18Q99952 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN18Q99952 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN18Q99952 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN18Q99952 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN18Q99952 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PTPN18Q99952 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN18Q99952 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN18Q99952 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN18Q99952 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN18Q99952 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN18Q99952 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN18Q99952 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN18Q99952 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms