Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT4

TRPM7, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM7Q96QT4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPM7Q96QT4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM7Q96QT4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM7Q96QT4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM7Q96QT4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM7Q96QT4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM7Q96QT4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPM7Q96QT4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPM7Q96QT4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPM7Q96QT4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPM7Q96QT4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM7Q96QT4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM7Q96QT4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRPM7Q96QT4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRPM7Q96QT4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRPM7Q96QT4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRPM7Q96QT4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms