Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
ALPK3Q96L96 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALPK3Q96L96 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALPK3Q96L96 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms