Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDAQ92838 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDAQ92838 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDAQ92838 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDAQ92838 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDAQ92838 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDAQ92838 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDAQ92838 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDAQ92838 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDAQ92838 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDAQ92838 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDAQ92838 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDAQ92838 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDAQ92838 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDAQ92838 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDAQ92838 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDAQ92838 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EDAQ92838 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EDAQ92838 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDAQ92838 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDAQ92838 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDAQ92838 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDAQ92838 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDAQ92838 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDAQ92838 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDAQ92838 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDAQ92838 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDAQ92838 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDAQ92838 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDAQ92838 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDAQ92838 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDAQ92838 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
EDAQ92838 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDAQ92838 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDAQ92838 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDAQ92838 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDAQ92838 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDAQ92838 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDAQ92838 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EDAQ92838 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDAQ92838 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDAQ92838 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDAQ92838 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDAQ92838 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDAQ92838 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDAQ92838 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDAQ92838 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDAQ92838 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDAQ92838 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EDAQ92838 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDAQ92838 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDAQ92838 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDAQ92838 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDAQ92838 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDAQ92838 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDAQ92838 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDAQ92838 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDAQ92838 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDAQ92838 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EDAQ92838 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDAQ92838 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDAQ92838 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDAQ92838 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDAQ92838 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDAQ92838 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDAQ92838 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDAQ92838 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDAQ92838 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EDAQ92838 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDAQ92838 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDAQ92838 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDAQ92838 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDAQ92838 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDAQ92838 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDAQ92838 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDAQ92838 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDAQ92838 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDAQ92838 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDAQ92838 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDAQ92838 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDAQ92838 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDAQ92838 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDAQ92838 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EDAQ92838 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDAQ92838 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDAQ92838 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDAQ92838 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDAQ92838 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDAQ92838 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDAQ92838 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDAQ92838 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDAQ92838 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDAQ92838 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EDAQ92838 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDAQ92838 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDAQ92838 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EDAQ92838 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDAQ92838 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EDAQ92838 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDAQ92838 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms