Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf43Q8TAL5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf43Q8TAL5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf43Q8TAL5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms