Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUMF1Q8NBK3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUMF1Q8NBK3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUMF1Q8NBK3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SUMF1Q8NBK3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms