Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS6Q8IU80 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMPRSS6Q8IU80 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS6Q8IU80 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms