Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYDE1Q6ZW31 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYDE1Q6ZW31 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms