Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINGO4Q6UY18 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINGO4Q6UY18 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LINGO4Q6UY18 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms