Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP58Q5T655 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFAP58Q5T655 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP58Q5T655 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms