Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FRMPD3Q5JV73 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FRMPD3Q5JV73 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FRMPD3Q5JV73 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FRMPD3Q5JV73 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms