Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNDC1Q4ZHG4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNDC1Q4ZHG4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC1Q4ZHG4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms