Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TBRG1Q3YBR2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TBRG1Q3YBR2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBRG1Q3YBR2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms