Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
DDB1Q16531 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
DDB1Q16531 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDB1Q16531 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
DDB1Q16531 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
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