Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL3Q13618 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CUL3Q13618 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CUL3Q13618 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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