Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHAF1BQ13112 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1BQ13112 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAF1BQ13112 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms