Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNB3Q05901 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms