Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCZQ05513 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCZQ05513 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCZQ05513 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms