Protein–RNA interactions for Protein: Q04726

TLE3, Transducin-like enhancer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE3Q04726 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TLE3Q04726 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TLE3Q04726 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLE3Q04726 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms