Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF90Q03938 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF90Q03938 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms