Protein–RNA interactions for Protein: Q02790

FKBP4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKBP4Q02790 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.511e-6■■■□□ 16
FKBP4Q02790 TRIB3-203ENST00000449710 1070 ntTSL 521.96■■□□□ 1.111e-6■■■□□ 16
FKBP4Q02790 TRIB3-204ENST00000615226 877 ntTSL 37.15□□□□□ -1.261e-6■■■□□ 16
FKBP4Q02790 D2HGDH-214ENST00000473126 1612 ntTSL 1 (best)29.9■■■□□ 2.382e-6■■■□□ 16
FKBP4Q02790 D2HGDH-215ENST00000486953 2232 ntTSL 1 (best)27.13■■□□□ 1.932e-6■■■□□ 16
FKBP4Q02790 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.212e-6■■■□□ 15.9
FKBP4Q02790 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.23■□□□□ 0.831e-7■■■□□ 15.8
FKBP4Q02790 CYHR1-207ENST00000528558 907 ntTSL 229.09■■■□□ 2.252e-6■■■□□ 15.8
FKBP4Q02790 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.965e-6■■■□□ 15.8
FKBP4Q02790 NINL-204ENST00000461642 594 ntTSL 319■□□□□ 0.635e-6■■■□□ 15.8
FKBP4Q02790 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.145e-6■■■□□ 15.8
FKBP4Q02790 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 15.8
FKBP4Q02790 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.032e-6■■■□□ 15.8
FKBP4Q02790 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 02e-6■■■□□ 15.8
FKBP4Q02790 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.112e-6■■■□□ 15.8
FKBP4Q02790 CAPN15-206ENST00000568402 540 ntTSL 418.85■□□□□ 0.613e-6■■■□□ 15.8
FKBP4Q02790 PAM16-210ENST00000575636 732 ntTSL 322.59■■□□□ 1.219e-12■■■□□ 15.7
FKBP4Q02790 PAM16-205ENST00000571986 606 ntTSL 322.4■■□□□ 1.189e-12■■■□□ 15.7
FKBP4Q02790 CORO7-PAM16-203ENST00000575334 3815 ntTSL 220.89■□□□□ 0.949e-12■■■□□ 15.7
FKBP4Q02790 CORO7-PAM16-201ENST00000572274 672 ntTSL 520.68■□□□□ 0.99e-12■■■□□ 15.7
FKBP4Q02790 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.899e-12■■■□□ 15.7
FKBP4Q02790 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.759e-12■■■□□ 15.7
FKBP4Q02790 PAM16-209ENST00000573614 650 ntTSL 519.5■□□□□ 0.719e-12■■■□□ 15.7
FKBP4Q02790 PAM16-202ENST00000571178 353 ntTSL 319.02■□□□□ 0.649e-12■■■□□ 15.7
FKBP4Q02790 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.549e-12■■■□□ 15.7
FKBP4Q02790 PAM16-213ENST00000575942 806 ntTSL 317.76■□□□□ 0.439e-12■■■□□ 15.7
FKBP4Q02790 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.039e-12■■■□□ 15.7
FKBP4Q02790 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.746e-7■■■□□ 15.7
FKBP4Q02790 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.296e-7■■■□□ 15.7
FKBP4Q02790 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.296e-7■■■□□ 15.7
FKBP4Q02790 ARFRP1-204ENST00000609537 593 ntTSL 318.91■□□□□ 0.625e-6■■■□□ 15.7
FKBP4Q02790 SEPT9-219ENST00000588575 559 ntTSL 426.28■■□□□ 1.82e-6■■■□□ 15.7
FKBP4Q02790 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 313.27□□□□□ -0.291e-6■■■□□ 15.7
FKBP4Q02790 SEPT9-227ENST00000590059 670 ntTSL 525.89■■□□□ 1.742e-6■■■□□ 15.6
FKBP4Q02790 SLC25A39-205ENST00000585636 561 ntTSL 229.37■■■□□ 2.292e-6■■■□□ 15.6
FKBP4Q02790 SLC25A39-206ENST00000585695 1121 ntTSL 229.37■■■□□ 2.292e-6■■■□□ 15.6
FKBP4Q02790 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.292e-6■■■□□ 15.6
FKBP4Q02790 SLC25A39-216ENST00000592857 837 ntTSL 327.43■■□□□ 1.982e-6■■■□□ 15.6
FKBP4Q02790 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.962e-6■■■□□ 15.6
FKBP4Q02790 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.72e-6■■■□□ 15.6
FKBP4Q02790 SLC25A39-210ENST00000588315 1409 ntTSL 225.65■■□□□ 1.72e-6■■■□□ 15.6
FKBP4Q02790 SLC25A39-209ENST00000588049 839 ntTSL 525.62■■□□□ 1.692e-6■■■□□ 15.6
FKBP4Q02790 SLC25A39-204ENST00000585523 574 ntTSL 425.62■■□□□ 1.692e-6■■■□□ 15.6
FKBP4Q02790 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.452e-6■■■□□ 15.6
FKBP4Q02790 SLC25A39-208ENST00000586633 566 ntTSL 323.3■■□□□ 1.322e-6■■■□□ 15.6
FKBP4Q02790 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.882e-6■■■□□ 15.6
FKBP4Q02790 SLC25A39-214ENST00000591151 636 ntTSL 219.11■□□□□ 0.652e-6■■■□□ 15.6
FKBP4Q02790 CYHR1-208ENST00000528663 5821 ntTSL 1 (best)17.85■□□□□ 0.452e-6■■■□□ 15.6
FKBP4Q02790 CYHR1-211ENST00000533173 6158 ntTSL 1 (best)17.18■□□□□ 0.342e-6■■■□□ 15.6
FKBP4Q02790 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.772e-6■■■□□ 15.6
FKBP4Q02790 SEPT9-235ENST00000591020 582 ntTSL 413.85□□□□□ -0.192e-6■■■□□ 15.5
FKBP4Q02790 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.113e-6■■■□□ 15.5
FKBP4Q02790 SEPT9-239ENST00000591704 749 ntTSL 215.25■□□□□ 0.031e-6■■■□□ 15.5
FKBP4Q02790 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.472e-6■■■□□ 15.5
FKBP4Q02790 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.122e-6■■■□□ 15.5
FKBP4Q02790 SEPT9-221ENST00000588958 879 ntTSL 220.5■□□□□ 0.871e-6■■■□□ 15.4
FKBP4Q02790 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.381e-6■■■□□ 15.4
FKBP4Q02790 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.712e-6■■■□□ 15.4
FKBP4Q02790 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.392e-6■■■□□ 15.4
FKBP4Q02790 HS6ST1-203ENST00000469019 559 ntTSL 418.86■□□□□ 0.611e-6■■■□□ 15.3
FKBP4Q02790 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.071e-6■■■□□ 15.3
FKBP4Q02790 ACTB-203ENST00000417101 472 ntTSL 428.61■■■□□ 2.173e-6■■■□□ 15.3
FKBP4Q02790 RHBDF2-202ENST00000585701 572 ntTSL 418.14■□□□□ 0.497e-7■■■□□ 15.3
FKBP4Q02790 RHBDF2-205ENST00000589526 629 ntTSL 214.39□□□□□ -0.117e-7■■■□□ 15.3
FKBP4Q02790 RHBDF2-210ENST00000591192 554 ntTSL 414.39□□□□□ -0.117e-7■■■□□ 15.3
FKBP4Q02790 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.114e-8■■■□□ 15.2
FKBP4Q02790 ASPSCR1-216ENST00000583503 641 ntTSL 323.45■■□□□ 1.345e-11■■■□□ 15.2
FKBP4Q02790 MTA1-216ENST00000498644 871 ntTSL 221.83■■□□□ 1.093e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 NAP1L4-203ENST00000430811 860 ntTSL 233.27■■■□□ 2.927e-9■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 39.51□□□□□ -0.894e-7■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 C19orf25-211ENST00000592486 2314 nt18.23■□□□□ 0.514e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.55e-25■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.115e-25■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 214.35□□□□□ -0.115e-25■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 CCND1-205ENST00000542367 476 ntTSL 1 (best)21.26■□□□□ 0.995e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.32e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.162e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 MXD4-202ENST00000510822 561 ntTSL 321.61■■□□□ 1.053e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 MXD4-205ENST00000515378 522 ntTSL 219.64■□□□□ 0.733e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 MBD3-211ENST00000592965 568 ntTSL 430.35■■■□□ 2.451e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.121e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.671e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.211e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 MBD3-204ENST00000585967 583 ntTSL 422.27■■□□□ 1.161e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.832e-7■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.316e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.176e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 RABL6-210ENST00000484471 2746 ntTSL 522.75■■□□□ 1.236e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.916e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.846e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 RABL6-208ENST00000464941 3361 ntTSL 220.13■□□□□ 0.816e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.496e-6■■■□□ 15.1
FKBP4Q02790 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.844e-6■■■□□ 15
FKBP4Q02790 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.494e-6■■■□□ 15
FKBP4Q02790 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.274e-6■■■□□ 15
FKBP4Q02790 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.244e-6■■■□□ 15
FKBP4Q02790 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.152e-6■■■□□ 15
FKBP4Q02790 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.213e-6■■■□□ 15
FKBP4Q02790 SREBF2-203ENST00000435061 770 ntTSL 322.55■■□□□ 1.23e-6■■■□□ 15
FKBP4Q02790 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.943e-6■■■□□ 15
Retrieved 100 of 2,944 protein–RNA pairs in 258.6 ms