Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG1Q02413 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DSG1Q02413 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DSG1Q02413 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms