Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
DSG1Q02413 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
DSG1Q02413 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
DSG1Q02413 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
DSG1Q02413 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
DSG1Q02413 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
DSG1Q02413 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
DSG1Q02413 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
DSG1Q02413 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
DSG1Q02413 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
DSG1Q02413 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
DSG1Q02413 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
DSG1Q02413 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
DSG1Q02413 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
DSG1Q02413 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
DSG1Q02413 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
DSG1Q02413 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
DSG1Q02413 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
DSG1Q02413 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
DSG1Q02413 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
DSG1Q02413 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
DSG1Q02413 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
DSG1Q02413 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
DSG1Q02413 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
DSG1Q02413 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
DSG1Q02413 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DSG1Q02413 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
DSG1Q02413 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DSG1Q02413 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
DSG1Q02413 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
DSG1Q02413 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
DSG1Q02413 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
DSG1Q02413 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
DSG1Q02413 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
DSG1Q02413 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
DSG1Q02413 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
DSG1Q02413 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
DSG1Q02413 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
DSG1Q02413 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
DSG1Q02413 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
DSG1Q02413 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
DSG1Q02413 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DSG1Q02413 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
DSG1Q02413 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
DSG1Q02413 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
DSG1Q02413 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
DSG1Q02413 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
DSG1Q02413 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DSG1Q02413 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DSG1Q02413 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
DSG1Q02413 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
DSG1Q02413 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DSG1Q02413 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DSG1Q02413 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DSG1Q02413 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
DSG1Q02413 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DSG1Q02413 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
DSG1Q02413 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
DSG1Q02413 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DSG1Q02413 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
DSG1Q02413 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
DSG1Q02413 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
DSG1Q02413 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
DSG1Q02413 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
DSG1Q02413 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
DSG1Q02413 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
DSG1Q02413 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DSG1Q02413 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
DSG1Q02413 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
DSG1Q02413 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
DSG1Q02413 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
DSG1Q02413 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
DSG1Q02413 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DSG1Q02413 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
DSG1Q02413 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
DSG1Q02413 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
DSG1Q02413 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
DSG1Q02413 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
DSG1Q02413 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
DSG1Q02413 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DSG1Q02413 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DSG1Q02413 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DSG1Q02413 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
DSG1Q02413 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DSG1Q02413 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DSG1Q02413 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
DSG1Q02413 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DSG1Q02413 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DSG1Q02413 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DSG1Q02413 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
DSG1Q02413 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
DSG1Q02413 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
DSG1Q02413 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
DSG1Q02413 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
DSG1Q02413 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
DSG1Q02413 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
DSG1Q02413 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
DSG1Q02413 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
DSG1Q02413 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
DSG1Q02413 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms