Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAT1AQ00266 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MAT1AQ00266 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAT1AQ00266 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms