Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIRPAP78324 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIRPAP78324 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SIRPAP78324 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIRPAP78324 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SIRPAP78324 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRPAP78324 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRPAP78324 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRPAP78324 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRPAP78324 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRPAP78324 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRPAP78324 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRPAP78324 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRPAP78324 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIRPAP78324 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIRPAP78324 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRPAP78324 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SIRPAP78324 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRPAP78324 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SIRPAP78324 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRPAP78324 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRPAP78324 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SIRPAP78324 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SIRPAP78324 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SIRPAP78324 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIRPAP78324 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIRPAP78324 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIRPAP78324 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRPAP78324 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SIRPAP78324 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms